En el año 2002, Toei Animation decide llevar a la animación la primera parte del tercer capítulo del manga, Hades - Santuario. Se planificó la historia en trece episodios los cuales comenzaron a transmitirse a partir del 9 de noviembre de ese mismo año. En Rozan, el antiguo maestro tiene una visión en la que Atenea es decapitada por Hades. En ese momento se da cuenta que al final ha llegado el día en que Hades y sus 108 Espectros volverán a la Tierra. En el Santuario, Mū se encuentra con que varios Caballeros han revivido por el poder de Hades a cambio de traer la cabeza de Atenea. Entre ellos Máscara de Muerte de Cáncer y Afrodita de Piscis son los primeros en pelear, junto a un misterioso tercer Caballero es capaz de destruir la increíble defensa de Mū. La pelea es interrumpida por Seiya pero Mū, quien le dice no tener otra opción al ver la desobediencia del Pegaso y lo ataca con su Starlight Extinction.